【学内限定】かずさDNA研究所への受託依頼(学内限定価格)

【学内限定】かずさDNA研究所への受託依頼(学内限定価格)

 愛媛大学はかずさDNA研究所と包括連携協定を締結しています。
 当分野が窓口となり、下記の次世代シーケンス解析(NGS解析)の受託解析をご依頼可能です。
 (愛媛大学に在籍している研究者の方限定です。愛媛大学に在籍の研究者を経由して学外の方のご依頼を間接的にお引き受けすることはできません。)
 かずさDNA研究所が所有する高機能なシーケンサーを用いたシーケンスにも対応します。
 学内利用者限定価格でご利用いただくことができます。
 解析費用につきましては、当部門のスタッフとの際に情報提供可能です。

 かずさDNA研究所への受託依頼で、次世代シーケンス解析の生データ(拡張子.fastq 等)を取得し、当部門に導入済みのデータ解析用PCを使ってデータ解析を行っている方が多くいらっしゃいます。

保有機器
  • NextSeq500
  • NextSeq2000
  • DNBSEQ
受託解析可能な解析一覧
  • バルクRNA-Seq
    • 3’RNA-Seq
    • 全長mRNA-Seq
    • 全長Total RNA-Seq
    • Small RNA-Seq
  • ゲノムシーケンス
    • 全ゲノムシーケンス
    • エクソームシーケンス
  • ロングリードPacbio Sequel解析
  • シングルセル解析
  • データ解析の簡易解析~詳細解析

かずさDNA研究所 NGS解析受託サービス一覧

かずさDNA研究所 公式HP

かずさDNA研究所 DNA解析センター

当部門の対応スタッフ一覧

岩﨑 智之(兼任教員)、徳永 順士(技術専門職員)

 

依頼フロー

  • Step1
    当部門へお問い合わせ

    ご相談内容(解析の種類、サンプルの数・種類、依頼内容、技術支援等)をご記入の上、当部門のメールアドレスにご送信ください。
     ikagaku-support[@]m.ehime-u.ac.jp
     ※[@]を半角のアットマークに置き換えてください。
     

  • Step2
    ご依頼内容の詳細確認、見積書のご確認

    メール、若しくは対面での打合せ(遠方の方はリモート会議)でご依頼内容の詳細を確認し、見積書をお送りいたします。
     

  • Step3
    かずさDNA研究所への受託解析依頼のご依頼

    かずさDNA研究所から提示された受託内容、見積書をご確認の上で、正式なご返答をお願いいたします。
    また、当部門にサンプルの事前調整作業(サンプルの品質確認、ライブラリ作製など)をご依頼の場合は、受託内容、見積書、当分野の免責事項・利用規約をご確認の上で、メールで正式なご依頼をお願いいたします。
     

  • Step4
    【任意】当部門でのサンプルの事前調整作業(サンプルの品質確認、ライブラリ作製など)の実施

     繁忙期(特に10月~1月)は、スタッフの対応・納期が遅くなりますのでご了承ください。

    Bioanalyzer受託解析(核酸サンプルの品質確認)のみの場合
    【納期の目安】 ※依頼の混雑状況により変動します。
     約1週間(受け取りから1週間を目途に解析開始)
    【納品方法】
     メールなどで解析結果のレポートをお送りします。
     ※ 受託解析時に余ったサンプル等は原則として返却いたしません。
     ※ かずさDNA研究所側へのライブラリの発送は、ご依頼者側で実施するようお願いいたします。

    ライブラリ作製の受託場合
    (次世代シーケンス解析用ライブラリ作製の受託、シングルセル解析装置 10xGenomics Chromium iX 受託)

    Bioanalyzer受託解析(核酸サンプルの品質確認)を実施した後に、ライブラリ作製を実施いたします。

    ●Bioanalyzer受託解析(核酸サンプルの品質確認)
    【納期の目安】 ※依頼の混雑状況により変動します。
     約1週間(受け取りから1週間以内を目途に解析開始)
     ↓
    ●経過報告・ご相談
     品質チェックに問題があった場合には、経過報告・ご相談をさせていただきます。
     ↓
    ●ライブラリ作製
    【納期の目安】 ※依頼の混雑状況により変動します。
     2週間~ (上記の品質確認後から2~3週間以内を目途に作製開始)
     ↓
    ●納品
     こちらで梱包し、クール便でご依頼者の所属先へ返送を行います。
     送料の支払手続きに関しましてはご依頼者側で調整・ご連絡ください。
     ※ 受託解析時に余ったサンプル等は原則として返却いたしません。
     ※ かずさDNA研究所側へのライブラリの発送は、ご依頼者側で実施するようお願いいたします。

  • Step5
    かずさDNA研究所への解析用サンプルの発送

     かずさDNA研究所側への解析用サンプルの発送は、ご依頼者側で実施するようお願いいたします。

  • Step6
    かずさDNA研究所側での受託解析の実施

     混雑状況によりますが、下記の納期で解析後のデータの納品があります。
     【納期】約1ヶ月
     【納品データ】ディスクに保存した状態でメール便で当部門宛てに発送されますので、
            到着次第で当部門スタッフよりご連絡いたします。

  • Step7
    納品物のお受け取り・ご確認

     

  • Step8
    料金のお支払い

    当部門のスタッフからの案内に従うようお願いいたします。
     

  • Step9
    データの詳細解析などのご依頼

    出力されたシーケンスデータ(.fastqファイル)などの詳細解析は、当部門の受託業務一覧からご依頼可能です。
    学内の方の場合、データ解析用PCの機器利用(機器の直接利用)により、安価に解析を実行可能です。