GO・GSEA・Pathway解析
次世代シーケンスデータ、メタボローム解析データ等の定量データ若しくは差分解析データ（countデータ、濃度定量データ等、若しくはFold-change, p-valueなどの統計値）について、基礎的な作図、GO解析、GSEA解析、Pathway解析(IPA (Ingenuity Pathway Analysis)など)を実施可能です。
岩﨑 智之（兼任教員）、徳永 順士（技術専門職員）、宮﨑 芽依（技術員）
利用可能なサービス・料金について
依頼内容・ボリュームによりますが、下記の金額でお引き受け可能です。
| カテゴリ | 詳細 | 学内料金 | 学外料金 |
|---|---|---|---|
| 【学内限定】機器利用 データ解析PC | CLC Genomics Workbenchを用いた データ解析、IPAでのパスウェイ解析 | 200円/15分 | – |
| 受託業務 データ解析受託（GO, GSEA, Pathway解析） | Web上のフリーツール、 コマンド操作用解析パッケージでの解析 | 6,250円～ | 12,500円～ |
| 受託業務 データ解析受託（IPAでのPathway解析のみ） | IPAでの網羅的なパスウェイ解析 | 9,100円～ | 39,800円～ |
| 受託業務 データ解析環境構築 | コマンド操作用解析パッケージでの データ解析環境をDockerを介して提供。 Jupyter Lab, RStudioでのコードの 編集・実行が可能。 | 要相談 | 要相談 |
| 受託業務 データ解析用アプリ構築 | マウス操作可能なアプリケーションを通じて、 コマンド操作用解析パッケージでデータ解析 を実行できる環境をDockerを介して提供。 Jupyter Lab, RStudioでのコードの 編集・実行が可能。 | 要相談 | 要相談 |
見積例・納品物など
データ解析受託（GO, GSEA, Pathway解析）
- 学内料金
- 学外料金
●見積条件
バルクRNA-Seqデータの遺伝子発現差解析後のcountデータ
サンプル数：6サンプル(N3×2群)
解析の種類：GO, GSEA, Pathway解析(KEGGなど)
●積算表
基本料金 5,000円/件×1件＝5,000円
技術料 1,250円/時間×3時間＝3,750円
機器使用料 800円/時間×3時間＝2,400円
合計 11,150円/件+オプション
●見積条件
バルクRNA-Seqデータの遺伝子発現差解析後のcountデータ
サンプル数：6サンプル(N3×2群)
解析の種類：GO, GSEA, Pathway解析(KEGGなど)
●積算表
基本料金 10,000円/件×1件＝10,000円
技術料 2,500円/時間×3時間＝7,500円
機器使用料 6,700円/時間×3時間＝20,100円
合計 37,600円/件+オプション
データ解析受託（IPAでの網羅的なPathway解析）
- 学内料金
- 学外料金
●見積条件
バルクRNA-Seqデータの遺伝子発現差解析後のcountデータ
サンプル数：6サンプル(N3×2群)
解析の種類：IPAでの網羅的なPathway解析
●積算表
基本料金 5,000円/件×1件＝5,000円
技術料 1,250円/時間×2時間＝2,500円
機器使用料 800円/時間×2時間＝1,600円
合計 9,100円/件+オプション
学内利用者の場合、当部門のデータ解析用PCの機器利用（機器の直接使用）がお勧めです。
上記のデータ解析用PCでIPAを初めてご利用の方は、ADRESスタッフが無料で解析に立ち合わせていただきます。（ご負担金額は機器使用料のみ）
●見積条件
バルクRNA-Seqデータの遺伝子発現差解析後のcountデータ
サンプル数：6サンプル(N3×2群)
解析の種類：IPAでの網羅的なPathway解析
●積算表
基本料金 10,000円/件×1件＝10,000円
技術料 2,500円/時間×2時間＝5,000円
機器使用料 12,400円/時間×2時間＝24,800円
合計 39,800円/件+オプション
リモート会議形式で、解析途中の画面を共有しつつ、細かい解析オプションの指定、技術的なディスカッションを実施ことが可能です。
（納品データのデモデータにつきましては、現在作成中。直接お問い合わせください。）
