受託解析の説明ページ
データ解析用アプリ構築 シングルセル解析アプリ
シングルセル解析アプリ 当部門の受託業務の１つである「データ解析環境用アプリ構築」で作製したアプリケーションです。 論文などで一般公開されているコマンドラインベースの解析パッケージ（コマンド操作、プログラミング言語の習得が必須）の活用に抵抗...
データ解析用アプリ構築 Visium 空間トランスクリプトーム解析アプリ
Visium 空間トランスクリプトーム解析アプリ 当部門の受託業務の１つである「データ解析環境用アプリ構築」で作製したアプリケーションです。 論文などで一般公開されているコマンドラインベースの解析パッケージ（コマンド操作、プログラミング言語...
受託業務 バルクRNA-Seq解析
バルクRNA-Seq解析 次世代シーケンス解析の生データ（.fastq）の取得からデータの詳細解析まで、幅広いサポートを実施可能です。 詳細解析の際には、遺伝子発現差解析、変異解析、上流・下流遺伝子の解析、GO解析、Pathway解析(IP...
技術支援 データ解析に必要なパソコンの準備
データ解析に必要なパソコンの準備 バイオインフォマティクス関係のデータ解析を行う上で必要なPCのスペックに関して記載いたします。 当部門のデータ解析環境構築（受託業務）、データ解析用アプリ構築（受託業務）のご依頼を検討している方は、以下の情...
受託業務 コマンド操作用技術サポート：解析パッケージの扱い方・エラー解消
技術サポート：解析パッケージの扱い方・エラー解消 コマンド操作を必要とする解析パッケージが論文で公開済みのデータなどで多く使用されていますが、その解析パッケージを扱うためには、Linux(もしくはUnix)での操作、パッケージの導入作業（環...
NGS受託解析 次世代シーケンサー iSeq100 受託解析
次世代シーケンサー iSeq100 受託解析2022年度に当部門に新しく導入されました。現在、学内受託を受付中です。（学外受託につきましては、要相談の上でお引き受けいたします。）シーケンスRUNのみを実施いたします。（ライブラリ作製の受託業...
NGS受託解析 シングルセル解析装置 10xGenomics Chromium iX 受託
シングルセル解析装置 10xGenomics Chromium iX 受託2022年度に当部門に新しく導入されました。学内、学外受託ともに受付中です。10xGenomics Chromium iX を用いたシングルセル解析用のライブラリ作製...
NGS受託解析 次世代シーケンサー MiSeq 受託解析
次世代シーケンサー MiSeq 受託解析 シーケンスRUNのみを実施いたします。（ライブラリ作製の受託業務はこちら） 受託解析が可能なのはRNA-Seqや疾患関連遺伝子の変異解析等の一部のアプリケーションのみです。 サンプル数、量、品質等に...
NGS受託解析 Bioanalyzer 受託解析（核酸サンプルの品質確認）
Bioanalyzer 受託解析（核酸サンプルの品質確認） RNAの品質確認(RIN値の算出)等を受託解析で実施可能です。TotalRNA用のキット、DNA用のキットの一部については在庫を所有していますので、必要なサンプル数分だけの受託解析...
受託業務 visium空間トランスクリプトーム解析
visium空間トランスクリプトーム解析 シーケンス解析後のデータ（matrix data）の詳細解析を実施可能です。 CellRangerで解析後のmatrix filesを使用し、Seurat, Scanpyを用いた解析等、ご希望の解析...