シングルセル解析

　10xChromium iXによるライブラリ作製、シーケンス解析後のデータ（matrix data）の詳細解析を実施可能です。

　CellRangerで解析後のmatrix filesを使用し、Seurat, Scanpyを用いた解析等、ご希望の解析・作図を実施します。
　生データ（.fastq）からの解析（CellRanger, CLC Genomics Workbench Premium等）も、データのサイズ次第ですが、当部門のPCのスペックで実行可能であればご依頼可能です。
　詳細解析の際には、遺伝子発現差解析、変異解析、上流・下流遺伝子の解析、GO解析、Pathway解析(IPA)等を実施し、ご希望の作図を実施します。

解析後のデータの納品時には、当部門の教職員による報告会、結果のディスカッション、今後の研究方針のご相談なども実施いたします。

スタッフ一覧

塩川大介（兼任教員）、宮﨑芽依（技術員）

利用可能なサービス・料金について

　依頼内容・ボリュームによりますが、下記の金額でお引き受け可能です。

カテゴリ	詳細	学内料金	学外料金
【学内限定】機器利用　データ解析PC	CLC Genomics Workbench Premiumを用いたデータ解析、IPAでのパスウェイ解析	200円/15分	–
受託業務　次世代シーケンス受託解析	10x Chromium iXによるライブラリ作製	詳細リンク	詳細リンク
受託業務　データ解析受託	コマンド操作用解析パッケージでの解析、 IPAでのパスウェイ解析	11,150円～	37,600円～
受託業務　データ解析環境構築	コマンド操作用解析パッケージでのデータ解析環境をDockerを介して提供。 Jupyter Lab, RStudioでのコードの編集・実行が可能。	2024年6月中旬公開予定	2024年6月中旬公開予定
受託業務　データ解析用アプリ構築	マウス操作可能なアプリケーションを通じて、コマンド操作用解析パッケージでデータ解析を実行できる環境をDockerを介して提供。 Jupyter Lab, RStudioでのコードの編集・実行が可能。	2024年6月中旬公開予定	2024年6月中旬公開予定

お見積・ご依頼のご相談

依頼フロー

他の受託業務メニュー

見積例・納品物など

10xChromium iXを用いたシングルセル解析用ライブラリ作製

学内料金
学外料金

●見積条件
3′ RNA-Seq
細胞サンプルからライブラリ作製を実施
サンプル数：2サンプル（※ 例として2サンプルで積算していますが、1サンプルからご依頼可能です。）
　消耗品１：キット代(HighSensitivity DNA kit)
　消耗品２：プラスチック消耗品
ライブラリ作製用キットはご依頼者が用意。
シーケンス解析はご依頼者が他組織にて実施。

●ご依頼者側の準備物（キット類）
※ ご依頼者の解析の用途に応じたものをご準備いただき、当部門にご発送ください。
　価格の詳細につきましては、各メーカーにお問い合わせください。
2サンプル解析時の費用：760,000円（※ 500-10000細胞/サンプル）
（1サンプルあたりの単価：380,000円）

●当部門のライブラリ作製受託費用の積算表
技術料　　　　　　　 1,250円/時間×8時間＝10,000円
Chromium iX使用料　4,000円/回×1回＝4,000円
Bioanalyzer使用料　　 200円/回×2回＝400円
消耗品１　　　　　　 8,600円/チップ×2チップ＝17,200円
消耗品２　　　　　　 1,500円/サンプル×2サンプル＝3,000円
合計　　　　　　　 34,600円/件
（1サンプルあたりの単価：17,300円）

●費用の合計
2サンプル解析時の費用：794,600円
（1サンプルあたりの単価：397,300円）

要相談

お見積・ご依頼のご相談

依頼フロー

他の受託業務メニュー

データ受託解析

学内料金
学外料金

●見積条件
シングルセルRNA-Seq
サンプル数：2サンプル(matrix file)

●積算表
基本料金　　5,000円/件×1件＝5,000円
技術料　　　1,250円/時間×3時間＝3,750円
機器使用料　 800円/時間×3時間＝2,400円
合計　　　　11,150円/件+オプション

ご依頼者の方向けにカスタマイズした機能解析、figureの再作成・修正が多くなるようであれば、オプション費用が＋2～3万円となるため、データ解析アプリ（若しくはデータ解析環境構築）＋当部門の技術支援の組み合わせをお勧めいたします。

●見積条件
シングルセルRNA-Seq
サンプル数：2サンプル(matrix file)

●積算表
基本料金　 10,000円/件×1件＝10,000円
技術料　　　2,500円/時間×3時間＝7,500円
機器使用料　6,700円/時間×3時間＝20,100円
合計　　　　37,600円/件+オプション

ご依頼者の方向けにカスタマイズした機能解析、figureの再作成・修正が多くなるようであれば、オプション費用がさらに加算されていくため、データ解析アプリ（若しくはデータ解析環境構築）＋当部門の技術支援の組み合わせの方をお勧めいたします。

1件の解析あたりの料金として積算するため、他組織よりも比較的安価に解析が可能です。
（サンプル数が上記の例より増えても、基本料金が変動しないため。）

お見積・ご依頼のご相談

依頼フロー

他の受託業務メニュー

（納品データのデモデータにつきましては、現在作成中。直接お問い合わせください。）
　